La vest de catedrală, baptisteriul liber a fost început în 1153, aproape o sută de ani după catedrală, dar încă în zilele mari ale orașului Pisa. Ea realizează designul catedralei folosind același material de construcție, modelat cu diferite culori de piatră, și de galeriile orb și piticii. Dar, pe măsură ce lucrările au continuat peste două secole, a început să arate tranziția de la romanică la gotică între nivelurile inferioare și superioare. În 1260, Nicola Pisano a preluat responsabilitatea pentru proiect, urmată (1285-93) de fiul său Giovanni. Domul conic se află pe patru stâlpi și opt coloane, creând un efect de lumină și solemnitate. Ca și catedrala, evidențiarea neclintită a baptisteriului este amvonul de marmură liberă, o capodoperă de 1260 de Nicola Pisano și una dintre marile capodopere ale sculpturii romane. Este decorat cu panouri de relief care ilustrează scene din Noul Testament cu mare intensitate artistică. Asigurați-vă, de asemenea, că fontul lui Guido da Como (1246) și cifrele sfinților de către studenții lui Nicola și Giovanni Pisano. Baptisteriul este de asemenea remarcabil pentru acustica sa superbă, pe care ghidurile o fac, de obicei, un punct de demonstrație.