Burgas este o regiune cu o mare importanță pentru biodiversitate. Lacul Burgas este cel mai mare lac din Bulgaria, chiar în mijlocul orașului, fiind foarte important pentru păsările migratoare: aici pot fi observate 250 de specii de păsări, dintre care 61 sunt în pericol de dispariție în Bulgaria și 9 pe plan global! Și fauna acvatică este foarte diversificată. Iar în timpul migrației, pot fi observate între 20 000 – 100 000 de păsări de apă. Sunt multe zone protejate în Burgas: lacul Burgas, lacul Atanasovo, lacul Mandra, zonele Poda, Usungeren, Chengene Skele și parcul național Strandzha.